ولد الشيخ عمر رضي الله عنه  بقرية المكاشفي " الصنقور" في  العام 1898م في بيت علم وصلاح ، و نشأ  ملازما لأبيه و خادما له ، حفظ القرآن الكريم ودرس العلوم و أخذ عهد الطريق المكاشفي على يد والده الشيخ المكاشفي وهو من أبرز و أوائل تلاميذه.

تولي خلافة السجادة المكاشفية وأمر  والإرشاد بعد وفاة والده الشيخ عبد الباقي المكاشفي في يوم 3/6/1960م  وأهتم في عهده بطلاب العلم و بإشعال نار( التقابه ) ، و كان رضي الله عليه كريما ذو علم و حكمة ، شمل الناس بفضله و بوده و طيب معشره ، و كان بارا بالناس و بتلاميذ والده " الأبكار" خاصة.

امتدت خلافته سبع سنين ، و أنتقل إلى جوار ربه في يوم 3/8/1967م ، قبر جسده الطاهر  في الشكينيبة داخل " قبة " والده الشيخ عبد الباقي المكاشفي رحمه الله وجزاه عنا خير الجزاء.

تولى أبنه الأكبر الشيخ النيل أمر خلافته وقام مقامه في الإرشاد من بعده ، ألا رحم الله الشيخ عمر الشيخ المكاشفي و جزاءه الله كل خير و نفع به وبأبنائه.